Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx18Q8VDS8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Stx18Q8VDS8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Stx18Q8VDS8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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