Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms