Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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