Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LgsnQ8CIX8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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LgsnQ8CIX8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LgsnQ8CIX8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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LgsnQ8CIX8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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