Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SbsnQ8CIT9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SbsnQ8CIT9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SbsnQ8CIT9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SbsnQ8CIT9 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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