Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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