Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms