Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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