Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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