Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

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Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms