Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms