Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms