Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmco3Q8BH01 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmco3Q8BH01 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms