Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4dQ8BGV9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms