Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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