Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms