Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms