Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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