Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sgo2Q7TSY8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sgo2Q7TSY8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sgo2Q7TSY8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sgo2Q7TSY8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sgo2Q7TSY8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sgo2Q7TSY8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sgo2Q7TSY8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sgo2Q7TSY8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms