Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms