Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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