Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sbno1Q689Z5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sbno1Q689Z5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms