Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PatjQ63ZW7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms