Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf6Q62311 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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