Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall3Q62255 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.8 ms