Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms