Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms