Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms