Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bhlha9Q5RJB0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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