Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl5Q5DTT4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms