Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9Q3V038 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9Q3V038 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9Q3V038 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9Q3V038 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9Q3V038 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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