Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BB287469Q3UT53 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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BB287469Q3UT53 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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