Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms