Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms