Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms