Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdgfl2Q3UMU9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hdgfl2Q3UMU9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hdgfl2Q3UMU9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hdgfl2Q3UMU9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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