Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms