Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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