Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Q3U6N9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Q3U6N9 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Q3U6N9 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Q3U6N9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Q3U6N9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Q3U6N9 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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