Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms