Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms