Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms