Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms