Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms