Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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