Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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