Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms