Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms