Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms