Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms